А откуда у Телефонной компании появилась эта собственность, которую она сдает в аренду?

Дополнительным соглашением №2 от 06.05.2014 стороны уменьшили площадь арендуемых помещений до 580 кв.м.
Ответчик свои обязательства по оплате арендных платежей исполнял ненадлежащим образом, в связи с чем за ним образовалась задолженность.

С 1 апреля 2013 года, по версии истца, за ответчиком стала образовываться задолженность, достигшая к концу июня следующего года суммы в 4 миллиона 379 тысяч рублей.

Согласно пункту 5.1 договора ежемесячная арендная плата за пользование имуществом (без НДС 18%) состоит из возмещаемой пропорционально занимаемой площади суммы, включающей в себя:
— сумму следующих фактически понесенных арендодателем затрат...;
— комплексного арендного сбора, составляющего сумму, равную 115,4% ставки годовой арендной платы за аренду 1 кв.м в рублях, устанавливаемой решением Городской Думы г. Саров Нижегородской области при сдаче в аренду муниципальных нежилых помещений.

http://docs.pravo.ru/document/view/68586216/?mode=full

Если я правильно понимаю то, что написал в решении № А43-5978/2015 Нижегородский арбитражный суд, составной частью ежемесячной арендной платы является "комплексный арендный сбор", составляющий сумму, равную 115,4% ставки годовой арендной платы, устанавливаемой Городской Думой г. Саров.
Ежемесячно с каждого сдаваемого в аренду квадратного метра ООО "ТКС" получает 115,4 ставки годовой арендной платы?

А всего в переданном в распоряжение Д.Щербухи здании ОАО "ТКС" по адресу ул. КУрчатова, 3 — 5130,8 кв. м.
И, судя по публикациям в газете "Голос Сарова", большую часть этих денег Д.Щербуха и А.Волгин различными путями направляют на пропаганду информационной войны против руководства РФЯЦ-ВНИИЭФ. Ну кое-что расходуется через выплату Д.Щербухе и А.Волгину официальной заработной платы на их дорогостоящие автомобили "Porche" и "Mercedes-Benz" и прочие предметы роскоши.
Можно брать калькулятор и считать в карманах "слуг народа" деньги, пускаемые ими на финансирование безобразной информационной войны.

Так кто наделил Щербуху собственностью за здорово живешь?

Собственность принадлежит городу. Щербуху назначили этой собственностью управлять члены совета директоров, поименованные в этом списке.

После уплаты ком. платежей оставшаяся часть аренды:
99,01% — Муниципальное образование г.Саров в лице КУМИ г.Саров;
0,99% — Фонд социального развития г.Саров:)
http://www.tcsarov.ru/site.aspx?IID=621944&SECTIONID=621195

Так само здание "Дома быта" кому принадлежит?

И чья летняя "пивнуха"?

Так само здание "Дома быта" кому принадлежит?

Здание принадлежит ОАО "ТКС", которое в свою очередь принадлежит муниципалитету. Пивнуха — скорее всего арендатора — которым вполне может выступать сам Щербуха как частный предприниматель или ООО, принадлежащее Щербухе. Пробейте там чек и посмотрите что на нем написано.